Μπορεί το πρωτάθλημα των αναβατών να είχε κριθεί, με τον Fabio Quartararo να παίρνει τον τίτλο, ωστόσο, το πρωτάθλημα των ομάδων ήταν ακόμη ανοικτό λίγο πριν ξεκινήσει ο αγώνας στο Portimao της Πορτογαλίας. Ο πρωταθλητής ξεκίνησε τον αγώνα από την έβδομη θέση και δυσκολεύτηκε καθ’ όλη την διάρκεια του απογεύματος να βρει ρυθμό. Με το που έσβησαν τα κόκκινα φώτα ο Francesco Bagnaia με την Ducati βρέθηκε σχεδόν αμέσως στην πρωτοπορία και δεν δυσκολεύτηκε να πάει μέχρι την νίκη. Μπορεί αρχικά να βρέθηκε ο Miller μπροστά από τον Bagnaia αλλά ήρθε αμέσως η μάχη με τον Mir δίδοντας έτσι την ευκαιρία στον Ιταλό αναβάτη της Ducati να αρπάξει την πρωτιά.
Ο περσινός πρωταθλητής, Joan Mir, κατάφερε να προσπεράσει τον Miller και, παρόλο του ότι έκανε ότι μπορούσε για να κυνηγήσει τον πρωτοπόρο Bagnaia, δεν έδειχνε να είχε την ταχύτητα για να κρατηθεί κοντά του. Μέχρι τον έβδομο γύρο, ο πρωτοπόρος Bagnaia άνοιξε μια απόσταση πέραν του δευτερολέπτου, ενώ δεν άργησε να φτάσει και τα δυο δευτερόλεπτα στον 16ο γύρο.
Ο αγώνας για το φετινό πρωταθλητή ολοκληρώθηκε στο 21ο γύρο μετά από πτώση στην στροφή 5, σημειώνοντας έτσι την πρώτη εγκατάλειψη του μέσα στο 2021. Τα πάντα όμως πάγωσαν στον προτελευταίο γύρο της κούρσας, μετά από σύγκρουση ανάμεσα στους Iker Lecuona (Tech3) και Miguel Oliveira, αμφότεροι με KTM. Με ένα γύρο να απομένει, και με την ασφάλεια πάντα στο μυαλό, αποφασίστηκε να τελειώσει εκεί η κούρσα, δίνοντας έτσι την νίκη στον Bagnaia αλλά και τον τίτλο στο πρωτάθλημα των ομάδων στην Ducati. Πίσω από τον Ιταλό, στην δεύτερη θέση, τερμάτισε ο περσινός πρωταθλητής Joan Mir, κατακτώντας έτσι και την καλύτερη θέση σε αγώνα φέτος, κλειδώνοντας και την τρίτη θέση στο πρωτάθλημα των αναβατών. Με τη σειρά του, ο Jack Miller έπειτα από μια ωραία μάχη με τον Alex Marquez, κατάφερε να ανέβει στην τρίτη θέση στο βάθρο με τον αναβάτη της Honda να τερματίζει τέταρτος.
Ο Zarco τερμάτισε στην πέμπτη θέση, μετά από ατύχημα του Quartararo ενώ την δεκάδα συμπλήρωσαν οι PolEspargaro, Jorge Martin, Alex Rins, o πρωτάρης της Avintia Enea Bastianini και ο Βrad Binder της KTM.
Και με τους δυο τίτλους να έχουν κριθεί, ο θεσμός του MotoGP έχει μόνο ένα αγώνα στο ημερολόγια πριν την αυλαία της σεζόν. Η πίστα Ricardo Tormo της Βαλένθια θα φιλοξενήσει την τελευταία συνάντηση του θεσμού, το Σαββατοκύριακο 13 με 14 Νοεμβρίου.
MotoGP Πορτογαλίας 2021
1 Francesco Bagnaia Ducati
2 Joan Mir Suzuki +2.478
3 Jack Miller Ducati +6.402
4 Alex Marquez Honda +6.453
5 Johann Zarco Ducat +7.882
6 Pol Espargaro Honda +9.573
7 Jorge Martin Ducati +10.144
8 Alex Rins Suzuki +10.742
9 Enea Bastianini Ducati +13.840
10 Brad Binder KTM +14.487